Протонные торпеды представляют собой высокоскоростные ударные разрывные снаряды, несущие мощные протонно-диффузионные боеголовки. Это оружие можно найти на борту большинства истребителей и боевых кораблей. Оно обладает огромным зарядом взрывчатой энергии и относится к числу наиболее мощных видов вооружения, пригодного для размещения на истребителях. Хотя оно заслужило наибольшую известность своей решающей ролью в уничтожении первой Звезды Смерти во время битвы при Явине, протонные торпеды имеют множество способов применения, включая атаки на тяжелые боевые корабли и точное наземное бомбометание.

Протонные торпеды, как правило, используются в качестве вспомогательного вооружения, дополняя основное оружие истребителей, состоящее из лазерных пушек. Из-за ограниченного пространства, истребители несут небольшой запас протонных торпед, да и те используются только в крайних случаях. Это связанно с дороговизной ракет. Залп из всех четырех лазерных пушек X-крыла, не идут ни в какое сравнение с разрушительной энергией даже одной ракеты, поэтому торпеды в основном применяются для уничтожения крупных боевых кораблей, которым не страшны лазерные укусы истребителей. Поскольку торпеда является физическим оружием, она свободно преодолевает стандартные дефлекторные щиты, предназначенные для защиты от энергетического оружия. Однако торпеда может быть остановлена щитом, состоящим из частиц.

Дальность действия торпед гораздо больше, чем у стандартных лазерных пушек. При попадании в цель, происходит термоядерная реакция, сопровождающаяся сильным выбросом энергии, протонная боеголовка торпеды взрывается, причиняя огромные физические повреждения, которые могут вывести из строя крупный звездолет. Начинка торпеды – взрывчатое вещество nergon-14. Каждая торпеда для предотвращения случайной детонации в результате столкновения с мелкими обломками уничтоженной техники или проносящимися в непосредственной близости разрядами лазерных выстрелов защищена энергетическим полем.

Сложные компьютеры наведения позволяют протонным торпедам отслеживать свою цель с 99 % успехом, поэтому оружие является высокоточным. Фактически, площадь рассеивания составляет меньше чем 3 м в диаметре. Достаточно быстрые звездолеты, при наличии опытного пилота, в состоянии обмануть торпеду, проведя маневр уклонения или просто оторваться от нее. Компьютер наведения в таких случаях, если теряет первоначальную цель, производит захват другой цели, которая находится ближе всего к торпеде. Для предотвращения этого явления пилоты иногда запускают торпеды с отключенной системой наведения, используя лишь визуальное наведение, но вероятность попадания в маневренную цель близка к нулю, если это не крупное судно.

Новореспубликанские Х-крылые истребители вооружены двумя торпедными установками Крупкс MG7, магазин каждой из которых вмещает три торпеды. Y-крылые истребители вооружены двумя установками Аракид Флекс Тьюб (с суммарным запасом в восемь торпед), а В-крылые - двумя установками Крупкс MG9 с шестью торпедами в каждой, Набуанский истребитель N-1 вооружен одной установкой с десятью торпедами. Имперские наступательные корабли, такие как штурмовой транспорт класса «Дельта» DX-9, DX-9s и Наступательный транспорт ATR производства судостроительной компании «КонГар», вооружены спаренными торпедными установками. Многие тяжелые корабли и орбитальные защитные станции также могут оснащаться оружием этого типа.

Первая Звезда Смерти была уничтожена, когда Люк Скайуокер пустил пару протонных торпед в незащищенный выхлопной порт, уничтожив станцию всего за считанные секунды до того, как ее суперлазер стер бы в прах главную повстанческую базу на планете Явин IV. Пожалуй, наиболее поразительным является тот факт, что Люк произвел решающий выстрел при отключенном компьютере наведения своего Х-крыла, полагаясь лишь на собственную меткость, и сумел поразить цель, составляющую всего два метра в диаметре.

В Битве за Набу, Анакин Скайуокер управляя истребителем N-1, также протонной торпедой уничтожил Корабль Управления Дроидами, что и решило исход сражения.

Некоторые пехотные подразделения вооружены наплечными или ранцевыми протонными ракетными установками. Несмотря на свой значительный вес и относительную дороговизну, эти установки достаточно надежно защищают пехоту от атак истребителей. Некоторые войсковые части начали даже заново переоборудовать свои суда, устанавливая аналогичные протонные торпедные комплексы.